未来三年内，合肥市计划重点实施102个水环境综合治理项目，总投资271亿元，其中2009年计划实施51个项目，总投资83亿元，当年计划投资31亿元，以加大治污力度，全面改善合肥市的水环境质量。目前《巢湖水环境综合治理总体方案》修改方案已上报，待国家发改委、环保部等部委联合批复。

    据合肥市发改委主任王厚亮介绍，该项目的资金筹措采取国家补助、地方投入、企业自筹、社会融资、争取外贷等多种方式解决，其中对经开区污水处理厂二期、垃圾焚烧发电厂等一批有一定经济效益的项目可争取BOT等方式解决。通过以上重点工程的实施，将会大幅提高合肥市污染物削减能力，计划到2010 年，该市工业及城镇生活的COD排放量控制在3.21万吨，氨氮排放量控制在5280吨。城镇污水处理规模达到100万吨/日，城区生活污水集中处理率达到95%以上。该市主要水体水质达到并保持Ⅴ类标准。重点工业污染源实现全面稳定达标排放。到2012年，实现水体功能区水质达标，饮用水源安全达标，污水不下河，城镇污水集中处理，污水稳定达标排放，城镇污水处理规模达到120万吨/日以上，城区生活污水处理率达到100%。